美洲黄莲‘AL1’遗传连锁图谱

遗传连锁图谱是研究植物基因组结构、进化的有力工具，是基因定位、克隆和分子标记辅助育种的重要基础。但作为被子植物中起源最早的植物之一，且素有“活化石”之称的莲，其基因组学研究却明显滞后。因此，构建莲遗传连锁图谱有助于莲基因组学研究的快速发展，为莲重要经济性状的分离和克隆提供依据，从而有利于进一步探索和充分利用莲的观赏、食用和药用价值。

水生植物资源学科组首先扫描了中国古代莲基因组序列，发现了86,089个SSR位点，其中73,246个SSR位点可用于开发SSR引物。然后以亚洲莲品种‘中国古代莲’和美洲黄莲品种‘AL1’杂交F1群体为材料，根据中国古代莲基因组序列信息开发的部分SSR分子标记（500对）分别构建了‘中国古代莲’和‘AL1’的遗传连锁图谱。由于‘中国古代莲’的基因组杂合度比较低，此图谱仅包含7个连锁群，有47个标记，图谱长度为365.67 cM。‘AL1’图谱包含11个连锁群，有177个分子标记，图谱长度为524.51 cM。这是首次报道莲的遗传连锁图谱，为莲基因组学研究奠定了良好基础，加快了莲重要基因定位、克隆和分子标记辅助育种的进程。

该研究成果以“Genetic linkage maps for Asian and American lotus constructed using novel SSR markers derived from the genome of sequenced cultivar”为题在BMC Genomics（doi:10.1186/1471-2164-13-653）上在线发表。

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